同时陈明将自已体内的上丹田的灵魂金丹，中丹田的生命金丹，下丹田的血气金丹全部注入到混沌的躯体之中。
在失去三颗金丹之后的陈明瞬间就苍老了五十多岁，不过混沌的躯体在容纳三颗金丹之后，身体开始散发出一丝丝的生命之力。
在注入三颗金丹之后，陈明的大部分的意识已经转移到混沌的躯体之中，在察觉到混沌的身体还是有一些问题之后，
陈明控制混沌的身体，进入到异空间开始吸收虚空之中的能量来提高自身的实力。在虚空能量的帮助下，混沌的实力从开始的零级，飞速提升到八十九级，
在八十九级的关卡上，陈明将混沌体内的三颗金丹完全破碎，将金丹中蕴含陈明的精气神与混沌的躯体完全融合，在这种情况之下，陈明的等级顺利突破到九十三级。
看到实力不会再提升之后，陈明撕开空间裂缝，来到了具有小部分灵魂的人类肉身的身边，
给肉身注入到五百年的寿命之后，陈明就缩小成为一颗宛如原子大小的球，进入到肉身的脑海之中。
在已经顺利突破到九十级以后，陈明也就不再隐藏神奥地区的实力，直接放出神奥地区所有的神兽，让他们进攻关都、成都地区。
当合众、卡洛斯、伽勒尔地区得知陈明这个举动之后，纷纷动用了各个地区大部分的神兽，准备进攻神奥地区，
但是就在他们一路顺风到达神奥地区的本土上之后，被混沌陈明随手一击的精神强念就全部给打昏了过去。
在收服这些神兽之后，陈明只是稍微露出了一丝丝混沌陈明的气势，就将他们给全部收服，
在得到这些神兽的帮助之下，关都地区直接被陈明给清除干净，所有御龙家族、大木家族、紫苑家族、
喷火龙纪家等家族全部被灭，所有与他们几家有关系的神奇宝贝全部被封印实力，等待他们的只有是联盟的审判。
在处理完关都、成都两个地区，其他几个地区也都阻挡不了陈明的脚步，一个接着一个被纳入到陈明帝国的控制范围内。
在做完这一切之后，原本陈明还准备去探索九个地区之外的迷雾之中的世界，但是就在混沌陈明进入到迷雾当中的时候，
陈明看到了阿尔宙斯遗留在迷雾当中的文字，通过这个文字，陈明了解到现如今的阿尔宙斯在其他的维度继续开辟着宇宙，
迷雾的对面是其他的世界，现在还没有到各个世界相互碰撞的时候。迷雾被他设下了封印，除非他解除迷雾，要不然谁也无法穿过迷雾。
在知道阿尔宙斯的留下来的消息之后，混沌陈明只能无功而返，回到神奥地区的天冠山上，一边继续培养自已的神奇宝贝，一边参悟法则。
